316 ورقة بحثية
تكشف هذه الدراسة أنه في خميرة الانشطار، يشكل معقد بروتين التضاعف أ (RPA) تجمعاً ثلاثياً حاسماً مع التيلوميراز (Trt1/TERT) ومكون الشيلترين Tpz1/TPP1 لدفع عملية استطالة التيلومير المثمرة وتثبيط إعادة الاندماج، وهي آلية يُرجح أنها محفوظة عبر البشر والخميرة المبرعمة.
لقد سحب المؤلفون مخطوطتهم المتعلقة بالبروتيوم البلازمي المستهدف عبر قياس الطيف الكتلي للفحص متعدد الأمراض بسبب مسألة إدارية تتعلق بموافقة المؤلف المشارك، وهم يطلبون عدم الاستشهاد بهذا العمل.
تقدم هذه الورقة إطار عمل مفتوح لضبط نموذج Boltz-2 باستخدام بيانات تجريبية خاصة بالمشروع لتعزيز قدراته في التنبؤ بآلفة الارتباط بين البروتين واللجين بشكل كبير من أجل تحسين الرصاص، محققة أداءً منافساً لطرق حساب تغير الطاقة الحرة.
تُظهر هذه الدراسة أن غلاف "أرك 1" (Arc1) الخاص بذبابة الخل، والذي تمت إعادة تشكيله مخبرياً وهندسته للارتباط بمستقبل "سوركس 2" (SORPS2) الثديي، يقوم بتوصيل محررات جين "كاس 9" (Cas9) بكفاءة إلى العضلات الضامرة في فئران "إم دي إكس" (mdx)، محققاً تخطياً كبيراً للإكسون واستعادةً للتعبير عن بروتين الدستروفين.
تكشف هذه الدراسة أن تصادمات بث الالتفاف بوساطة الكوهيسين، وليس مجرد إشغال بروتين CTCF وحده، هي التي تحافظ بنشاط على البنية المنظمة للنيوكليوسومات عند مواقع CTCF ومواقع بدء النسخ.
تُرسخ هذه الدراسة سير عمل عاماً وشاملاً لاكتشاف الببتيدات الدوائية من الصفر عبر استخدام التعلم العميق لتصميم وتحسين والتحقق من فعالية محفز حلقي جديد لمستقبل MC4R، والذي حقق قوة عالية وخفض استهلاك الغذاء بشكل ملحوظ لدى الفئران.
من خلال الطفرات عالية الإنتاجية وتحليل SHAPE-MAP لإنترون MAP3K7، تكشف هذه الدراسة أنه بينما تُعد طفرات نقطة التفرع هي المحركات الأساسية لتنشيط مواقع الربط الخفية في سياق طفرات SF3B1، فإن عملية الربط الدقيقة يتم الحفاظ عليها من خلال التباين الهيكلي الواسع للرنا بدلاً من بنية واحدة محفوظة، باستثناء بقع معينة لبروتينات ربط الرنا حيث يرتبط التشابه الهيكلي بنتائج عملية الربط.
تقدم الورقة البحثية Easymode، وهي مكتبة من شبكات التجزئة العامة مسبقة التدريب والمدرّبة على أكثر من 4,000 سلسلة ميل (tilt series)، والتي تتيح سير عمل مرنًا وخاليًا من التدريب لتحديد واستخراج وتحليل الجزيئات الكبيرة في التصوير المقطعي الإلكتروني بالتبريد (cryo-ET) داخل الخلايا، وهو ما تم إثباته من خلال تحديد البنية الموضعية لـ IMPDH بـ دقة 4.0 أنغستروم لخيوط IMPDH ورسم خرائط بيئتها الخلوية.
تُظهر هذه الدراسة أن الاستجابة التكيفية الناجمة عن الإشعاع بجرعات منخفضة في الخلايا اللمفاوية البشرية تقلل بشكل كبير من إشارات كسر شريط الحمض النووي المزدوج الأولية (المقاسة ببؤر γH2AX) بطريقة تعتمد على الوقت وعلى نوع الخلايا، مع حدوث أقصى قدر من الحماية بعد 15 ساعة من التحفيز الأولي.
تقدم هذه الورقة استراتيجية مائيات دقيقة (microfluidic) عامة تستخدم علامات الألفة (affinity tags) لالتقاط البروتينات واستخلاصها ضوئياً مباشرة من أحجام دنيا من المستخلصات الخلوية أو نواتج الترجمة في المختبر، مما يتيح تحديد البنية بالمنظار الإلكتروني المبرد (Cryo-EM) عالي الدقة مع تقليل استهلاك العينات ووقت التحضير بشكل جذري مقارنة بسير العمل التقليدي.